与水温的高低、水质的好坏等都会影响柱状活性炭的吸附能力。水温越高，活性炭的吸附能力就越强，当水温超过30℃时，吸附能力便达到了极限，并且还会有逐渐降低的可能。还有就是水质的pH不稳定也会对活性炭的吸附能力产生影响。当水质呈碱性时，活性炭对阳离子的吸附能力会减弱;当水质呈酸性时，活性炭对阴离子的吸附能力会减弱。

　　柱状活性炭的吸附能力与水接触时间成正比，接触时间越长，过滤后的水质越好。过滤后的水应缓慢地流出过滤层。新的活性炭应在第一次使用前清洗干净，否则会有黑色的水流出。活性炭装入过滤器之前，应把2至3厘米厚的海绵添加到底部和顶部上，其作用是防止藻类等大颗粒杂质渗透，活性炭使用2至3个月后，如果过滤效果有所降低，应更换为新的活性炭，海绵层也应定期更换。

　　柱状活性炭在颗粒表面形成一层平衡的表面浓度，然后将有机杂质吸附到活性炭颗粒中，在使用初期具有较高的吸附效果。但随着时间的推移，活性炭的吸附能力会有不同程度的减弱，吸附效果也会下降。如果水族箱内水质混浊，水中有机物含量高，活性炭很快就会失去过滤功能。因此，活性炭应定期清洗或更换。

　　柱状活性炭的粒径也会影响吸附容量。一般而言，活性炭粒径越小，过滤面积越大。粉末状活性炭的总面积较大，吸附效果也更好，但粉末状活性炭容易随水流入水族箱，难以控制，很少使用。颗粒活性炭不易流动，因为水中会形成颗粒，水中有机物及活性炭过滤层中的其他杂质不易堵塞，其吸附能力强，便于携带和更换。